Run information

Run information#

Dataset: ag-vampir-002
Panel: ag-vampir
Cohort columns: location,taxon

Execution time: 2025-04-23 21:50:53

Reference genome#

reference value
0 reference-name AgamP4
1 reference-fasta resources/reference/Anopheles-gambiae-PEST_CHROMOSOMES_AgamP4.fa
2 reference-gff3 resources/reference/Anopheles-gambiae-PEST_BASEFEATURES_AgamP4.12.gff3
3 reference-snpeffdb Anopheles_gambiae

Panel information#

contig start end amplicon mutation ref alt
0 2L 209535 209536 Agam_1 AIM1 A G
1 2L 927246 927247 Agam_2 AIM2 C A
2 2L 1274352 1274353 Agam_3 AIM3 G A
3 2L 1418209 1418210 Agam_4 AIM4 T C
4 2L 1571928 1571929 Agam_5 AIM5 T C
5 2L 1776347 1776348 Agam_6 AIM6 G C
6 2L 1947573 1947574 Agam_7 AIM7 G A
7 2L 2380981 2380982 Agam_8 Vgsc_tag1 T C
8 2L 2381705 2381706 Agam_9 Vgsc_tag2 A G
9 2L 2388594 2388595 Agam_10 Vgsc_tag3 G T
10 2L 2391227 2391228 Agam_79 Vgsc_V402L G C,T
11 2L 2399996 2399997 Agam_11 Vgsc_D466H G C
12 2L 2403940 2403941 Agam_12 Vgsc_tag4 T C
13 2L 2408422 2408423 Agam_13 Vgsc_tag5 C T
14 2L 2408676 2408677 Agam_14 Vgsc_tag6 A C
15 2L 2414061 2414062 Agam_15 Vgsc_tag7 A T
16 2L 2416979 2416980 Agam_16 Vgsc_T791M C T
17 2L 2422650 2422651 Agam_17 Vgsc_L995S T C
18 2L 2422651 2422652 Agam_17 Vgsc_L995F A T
19 2L 2425051 2425052 Agam_18 Vgsc_tag8 G A
20 2L 2425765 2425766 Agam_19 Vgsc_tag9 T A
21 2L 2429616 2429617 Agam_80 Vgsc_I1527T T C
22 2L 2429744 2429745 Agam_20 Vgsc_N1570Y A T
23 2L 2429896 2429897 Agam_20 Vgsc_E1597G A G
24 2L 2430423 2430424 Agam_21 Vgsc_A1746S G T
25 2L 2430816 2430817 Agam_22 Vgsc_V1853I G A
26 2L 2430862 2430863 Agam_22 Vgsc_I1868T C T
27 2L 2430879 2430880 Agam_22 Vgsc_P1874S C T
28 2L 2430880 2430881 Agam_22 Vgsc_P1874L C T
29 2L 2431004 2431005 Agam_23 AIM8 T C
30 2L 2431060 2431061 Agam_23 Vgsc_A1934V C T
31 2L 2432418 2432419 Agam_24 Vgsc_tag10 T G
32 2L 2435580 2435581 Agam_25 Vgsc_tag11 T A
33 2L 20288131 20288132 Agam_26 Coeae1d_tag T C
34 2L 25429234 25429235 Agam_27 Rdl_A296S G T
35 2L 25429235 25429236 Agam_27 Rdl_A296G C G
36 2L 25635972 25635973 Agam_28 Cyp4j5_L43F G A
37 2L 34073194 34073195 Agam_29 34mb_tag1 C T
38 2L 34100757 34100758 Agam_30 34mb_tag2 A T
39 2L 34118140 34118141 Agam_31 34mb_tag3 G A
40 2L 34118259 34118260 Agam_31 34mb_tag4 G A
41 2R 3492073 3492074 Agam_32 Ace1_G280S G A
42 2R 8368730 8368731 Agam_33 AIM9 C A
43 2R 17854286 17854287 Agam_34 AIM10 A C
44 2R 28492878 28492879 Agam_35 Cyp6p3_I88T A G
45 2R 28494246 28494247 Agam_36 Cyp6_tag1 A C
46 2R 28497562 28497563 Agam_37 Cyp6_tag2 T C
47 2R 28497966 28497967 Agam_38 Cyp6p4_I236M G C
48 2R 28498191 28498192 Agam_39 Cyp6_tag3 C G
49 2R 28499660 28499661 Agam_40 Cyp6_tag4 G T
50 2R 28500642 28500643 Agam_41 Cyp6_tag5 G A
51 2R 28501398 28501399 Agam_42 Cyp6_tag6 G A
52 2R 28502735 28502736 Agam_43 Cyp6_tag7 C A
53 2R 28502849 28502850 Agam_43 Cyp6_tag8 C T
54 2R 48714600 48714601 Agam_81 DSX1 NaN NaN
55 2R 48714550 48714551 Agam_82 DSX2 NaN NaN
56 2R 49438585 49438586 Agam_44 AIM11 T C
57 3L 65132 65133 Agam_45 AIM12 G T
58 3L 129050 129051 Agam_46 AIM13 C A
59 3L 193172 193173 Agam_47 AIM14 A G
60 3L 367247 367248 Agam_48 AIM15 C A
61 3L 380973 380974 Agam_49 AIM16 C A
62 3L 413507 413508 Agam_50 AIM17 G A
63 3L 11208464 11208465 Agam_51 Tep1A A G
64 3L 11213954 11213955 Agam_52 Tep1B G T
65 3R 34263 34264 Agam_53 AIM18 G A
66 3R 35120 35121 Agam_54 AIM19 G A
67 3R 38160 38161 Agam_55 AIM20 G A
68 3R 42847 42848 Agam_56 AIM21 C A
69 3R 50589 50590 Agam_57 AIM22 G T
70 3R 71972 71973 Agam_58 AIM23 A C
71 3R 97616 97617 Agam_59 AIM24 A G
72 3R 8564155 8564156 Agam_60 D7R2 G A
73 3R 28592157 28592158 Agam_61 Gste_tag1 G A
74 3R 28595448 28595449 Agam_62 Gste_tag2 C T
75 3R 28598056 28598057 Agam_63 Gste_F120L G C
76 3R 28598061 28598062 Agam_63 Gste_L119V G C
77 3R 28598165 28598166 Agam_63 Gste_I114T A G
78 3R 28600700 28600701 Agam_64 Gste_tag3 A G
79 X 15249653 15249654 Agam_65 Cyp9k1_tag1 A G
80 X 15251489 15251490 Agam_66 Cyp9k1_tag2 C T
81 X 15255320 15255321 Agam_67 Cyp9k1_tag3 A T
82 X 18758299 18758300 Agam_68 AIM25 T C
83 X 19631624 19631625 Agam_69 AIM26 G C
84 X 20014695 20014696 Agam_70 AIM27 C A
85 X 20128327 20128328 Agam_71 AIM28 T C
86 X 20129287 20129288 Agam_72 AIM29 T G
87 X 21721800 21721801 Agam_73 AIM30 G C
88 X 22164042 22164043 Agam_74 AIM31 T C
89 X 22798647 22798648 Agam_75 AIM32 C A
90 X 23468267 23468268 Agam_76 AIM33 T A
91 X 24229845 24229846 Agam_77 AIM34 G A
92 X 24266727 24266728 Agam_78 AIM35 T A

Input metadata#

sample_id sample_name index index2 plate taxon location country latitude longitude well_letter well_number
0 GH_01 GH_01 ATCACGTT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN A 1
1 GH_02 GH_02 CGATGTTT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN A 2
2 GH_03 GH_03 TTAGGCAT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN A 3
3 GH_04 GH_04 TGACCACT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN A 4
4 GH_05 GH_05 ACAGTGGT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN A 5
5 GH_06 GH_06 GCCAATGT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN A 6
6 GH_07 GH_07 CAGATCTG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN A 7
7 GH_08 GH_08 ACTTGATG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN A 8
8 GH_09 GH_09 GATCAGCG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN A 9
9 GH_10 GH_10 TAGCTTGT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN A 10
10 GH_11 GH_11 GGCTACAG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN A 11
11 GH_12 GH_12 CTTGTACT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN A 12
12 GH_13 GH_13 TGGTTGTT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN B 1
13 GH_14 GH_14 TCTCGGTT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN B 2
14 GH_15 GH_15 TAAGCGTT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN B 3
15 GH_16 GH_16 TCCGTCTT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN B 4
16 GH_17 GH_17 TGTACCTT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN B 5
17 GH_18 GH_18 TTCTGTGT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN B 6
18 GH_19 GH_19 TCTGCTGT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN B 7
19 GH_20 GH_20 TTGGAGGT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN B 8
20 GH_21 GH_21 TCGAGCGT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN B 9
21 GH_22 GH_22 TGATACGT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN B 10
22 GH_23 GH_23 TGCATAGT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN B 11
23 GH_24 GH_24 TTGACTCT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN B 12
24 GH_25 GH_25 TGCGATCT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN C 1
25 GH_26 GH_26 TTCCTGCT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN C 2
26 GH_27 GH_27 TAGTGACT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN C 3
27 GH_28 GH_28 TACAGGAT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN C 4
28 GH_29 GH_29 TCCTCAAT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN C 5
29 GH_30 GH_30 TGTGGTTG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN C 6
30 GH_31 GH_31 TAGTCTTG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN C 7
31 GH_32 GH_32 TTCCATTG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN C 8
32 GH_33 GH_33 TCGAAGTG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN C 9
33 GH_34 GH_34 TAACGCTG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN C 10
34 GH_35 GH_35 TTGGTATG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN C 11
35 GH_36 GH_36 TGAACTGG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN C 12
36 GH_37 GH_37 TACTTCGG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN D 1
37 GH_38 GH_38 TCTCACGG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN D 2
38 GH_39 GH_39 TCAGGAGG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN D 3
39 GH_40_low_vol GH_40_low_vol TAAGTTCG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN D 4
40 GH_41 GH_41 TCCAGTCG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN D 5
41 GH_42 GH_42 TGTATGCG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN D 6
42 GH_43 GH_43 TCATTGAG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN D 7
43 GH_44 GH_44 TGGCTCAG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN D 8
44 GH_45 GH_45 TATGCCAG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN D 9
45 GH_46 GH_46 TCAGATTC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN D 10
46 GH_47 GH_47 TACTAGTC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN D 11
47 GH_48 GH_48 TTCAGCTC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN D 12
48 GH_49 GH_49 TGTCTATC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN E 1
49 GH_50 GH_50 TATGTGGC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN E 2
50 GH_51 GH_51 TTACTCGC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN E 3
51 GH_52 GH_52 TCGTTAGC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN E 4
52 GH_53 GH_53 TACCGAGC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN E 5
53 GH_54 GH_54 TGTTCTCC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN E 6
54 GH_55 GH_55 TTCGCACC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN E 7
55 GH_56 GH_56 TTGCGTAC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN E 8
56 GH_57 GH_57 TCTACGAC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN E 9
57 GH_58 GH_58 TGACAGAC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN E 10
58 GH_59 GH_59 TAGAACAC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN E 11
59 GH_60 GH_60 TCATCCTA CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN E 12
60 GH_61 GH_61 TGCTGATA CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN F 1
61 GH_62 GH_62 TAGACGGA CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN F 2
62 GH_63 GH_63 TGTGAAGA CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN F 3
63 GH_64 GH_64 TCTCTTCA CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN F 4
64 GH_65_low_vol GH_65_low_vol TTGTTCCA CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN F 5
65 GH_66 GH_66 TGAAGCCA CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN F 6
66 GH_67 GH_67 TACCACCA CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN F 7
67 GH_68 GH_68 TGCGTGAA CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN F 8
68 GH_69 GH_69 GGTGAGTT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN F 9
69 GH_70 GH_70 GATCTCTT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN F 10
70 GH_71 GH_71 GTGTCCTT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN F 11
71 GH_72 GH_72 GACGGATT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN F 12
72 GH_73 GH_73 GCAACATT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN G 1
73 GH_74 GH_74 GGTCGTGT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN G 2
74 GH_75 GH_75 GAATCTGT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN G 3
75 GH_76 GH_76 GTACATCT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN G 4
76 GH_77 GH_77 GAGGTGCT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN G 5
77 GH_78 GH_78 GCATGGCT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN G 6
78 GH_79 GH_79 GTTAGCCT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN G 7
79 GH_80_low_vol GH_80_low_vol GTCGCTAT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN G 8
80 GH_81 GH_81 GGAATGAT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN G 9
81 GH_82 GH_82 GAGCCAAT CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN G 10
82 GH_83 GH_83 GCTCCTTG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN G 11
83 GH_84 GH_84 GTAAGGTG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN G 12
84 GH_85 GH_85 GAGGATGG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN H 1
85 GH_86 GH_86 GTTGTCGG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN H 2
86 GH_87 GH_87 GGATTAGG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN H 3
87 GH_88 GH_88 GATAGAGG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN H 4
88 GH_89 GH_89 GTGTGTCG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN H 5
89 GH_90 GH_90 GCAATCCG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN H 6
90 GH_91 GH_91 GACCTTAG CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN H 7
91 GH_92 GH_92 GCCTGTTC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN H 8
92 GH_93 GH_93 GCACTGTC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN H 9
93 GH_94 GH_94 GCTAACTC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN H 10
94 GH_95 GH_95 GATTCATC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN H 11
95 GH_Negative GH_Negative GTCTTGGC CCTATCCT 3 NaN Obuasi Ghana NaN NaN H 12
96 GM_01 GM_01 ATCACGTT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN A 1
97 GM_02 GM_02 CGATGTTT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN A 2
98 GM_03 GM_03 TTAGGCAT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN A 3
99 GM_04 GM_04 TGACCACT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN A 4
100 GM_05 GM_05 ACAGTGGT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN A 5
101 GM_06 GM_06 GCCAATGT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN A 6
102 GM_07 GM_07 CAGATCTG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN A 7
103 GM_08 GM_08 ACTTGATG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN A 8
104 GM_09 GM_09 GATCAGCG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN A 9
105 GM_10 GM_10 TAGCTTGT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN A 10
106 GM_11 GM_11 GGCTACAG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN A 11
107 GM_12 GM_12 CTTGTACT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN A 12
108 GM_13 GM_13 TGGTTGTT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN B 1
109 GM_14 GM_14 TCTCGGTT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN B 2
110 GM_15 GM_15 TAAGCGTT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN B 3
111 GM_16 GM_16 TCCGTCTT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN B 4
112 GM_17 GM_17 TGTACCTT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN B 5
113 GM_18 GM_18 TTCTGTGT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN B 6
114 GM_19 GM_19 TCTGCTGT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN B 7
115 GM_20 GM_20 TTGGAGGT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN B 8
116 GM_21 GM_21 TCGAGCGT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN B 9
117 GM_22 GM_22 TGATACGT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN B 10
118 GM_23 GM_23 TGCATAGT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN B 11
119 GM_24 GM_24 TTGACTCT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN B 12
120 GM_25 GM_25 TGCGATCT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN C 1
121 GM_26 GM_26 TTCCTGCT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN C 2
122 GM_27 GM_27 TAGTGACT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN C 3
123 GM_28 GM_28 TACAGGAT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN C 4
124 GM_29 GM_29 TCCTCAAT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN C 5
125 GM_30 GM_30 TGTGGTTG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN C 6
126 GM_31 GM_31 TAGTCTTG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN C 7
127 GM_32 GM_32 TTCCATTG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN C 8
128 GM_33 GM_33 TCGAAGTG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN C 9
129 GM_34 GM_34 TAACGCTG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN C 10
130 GM_35 GM_35 TTGGTATG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN C 11
131 GM_36 GM_36 TGAACTGG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN C 12
132 GM_37 GM_37 TACTTCGG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN D 1
133 GM_38 GM_38 TCTCACGG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN D 2
134 GM_39 GM_39 TCAGGAGG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN D 3
135 GM_40 GM_40 TAAGTTCG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN D 4
136 GM_41 GM_41 TCCAGTCG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN D 5
137 GM_42 GM_42 TGTATGCG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN D 6
138 GM_43 GM_43 TCATTGAG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN D 7
139 GM_44 GM_44 TGGCTCAG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN D 8
140 GM_45 GM_45 TATGCCAG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN D 9
141 GM_46 GM_46 TCAGATTC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN D 10
142 GM_47 GM_47 TACTAGTC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN D 11
143 GM_48 GM_48 TTCAGCTC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN D 12
144 GM_49 GM_49 TGTCTATC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN E 1
145 GM_50 GM_50 TATGTGGC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN E 2
146 GM_51 GM_51 TTACTCGC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN E 3
147 GM_52 GM_52 TCGTTAGC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN E 4
148 GM_53 GM_53 TACCGAGC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN E 5
149 GM_54 GM_54 TGTTCTCC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN E 6
150 GM_55 GM_55 TTCGCACC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN E 7
151 GM_56 GM_56 TTGCGTAC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN E 8
152 GM_57 GM_57 TCTACGAC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN E 9
153 GM_58 GM_58 TGACAGAC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN E 10
154 GM_59 GM_59 TAGAACAC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN E 11
155 GM_60 GM_60 TCATCCTA GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN E 12
156 GM_61 GM_61 TGCTGATA GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN F 1
157 GM_62 GM_62 TAGACGGA GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN F 2
158 GM_63 GM_63 TGTGAAGA GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN F 3
159 GM_64 GM_64 TCTCTTCA GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN F 4
160 GM_65 GM_65 TTGTTCCA GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN F 5
161 GM_66 GM_66 TGAAGCCA GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN F 6
162 GM_67 GM_67 TACCACCA GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN F 7
163 GM_68 GM_68 TGCGTGAA GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN F 8
164 GM_69 GM_69 GGTGAGTT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN F 9
165 GM_70 GM_70 GATCTCTT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN F 10
166 GM_71 GM_71 GTGTCCTT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN F 11
167 GM_72 GM_72 GACGGATT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN F 12
168 GM_73 GM_73 GCAACATT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN G 1
169 GM_74 GM_74 GGTCGTGT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN G 2
170 GM_75 GM_75 GAATCTGT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN G 3
171 GM_76 GM_76 GTACATCT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN G 4
172 GM_77 GM_77 GAGGTGCT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN G 5
173 GM_78 GM_78 GCATGGCT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN G 6
174 GM_79 GM_79 GTTAGCCT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN G 7
175 GM_80 GM_80 GTCGCTAT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN G 8
176 GM_81 GM_81 GGAATGAT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN G 9
177 GM_82 GM_82 GAGCCAAT GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN G 10
178 GM_83 GM_83 GCTCCTTG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN G 11
179 GM_84 GM_84 GTAAGGTG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN G 12
180 GM_85 GM_85 GAGGATGG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN H 1
181 GM_86 GM_86 GTTGTCGG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN H 2
182 GM_87 GM_87 GGATTAGG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN H 3
183 GM_88 GM_88 GATAGAGG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN H 4
184 GM_89 GM_89 GTGTGTCG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN H 5
185 GM_90 GM_90 GCAATCCG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN H 6
186 GM_91 GM_91 GACCTTAG GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN H 7
187 GM_92 GM_92 GCCTGTTC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN H 8
188 GM_93 GM_93 GCACTGTC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN H 9
189 GM_94 GM_94 GCTAACTC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN H 10
190 GM_95 GM_95 GATTCATC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN H 11
191 GM_96 GM_96 GTCTTGGC GTACTGAC 8 NaN Gambia_URR Gambia NaN NaN H 12
192 VK7_dead_01 VK7_dead_01 ATCACGTT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN A 1
193 VK7_dead_02 VK7_dead_02 CGATGTTT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN A 2
194 VK7_dead_03 VK7_dead_03 TTAGGCAT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN A 3
195 VK7_dead_04 VK7_dead_04 TGACCACT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN A 4
196 VK7_dead_05 VK7_dead_05 ACAGTGGT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN A 5
197 VK7_dead_06 VK7_dead_06 GCCAATGT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN A 6
198 VK7_alive_01 VK7_alive_01 CAGATCTG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN A 7
199 VK7_alive_02 VK7_alive_02 ACTTGATG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN A 8
200 VK7_alive_03 VK7_alive_03 GATCAGCG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN A 9
201 VK7_alive_04 VK7_alive_04 TAGCTTGT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN A 10
202 VK7_alive_05 VK7_alive_05 GGCTACAG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN A 11
203 VK7_alive_06 VK7_alive_06 CTTGTACT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN A 12
204 VK7_dead_07 VK7_dead_07 TGGTTGTT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN B 1
205 VK7_dead_08 VK7_dead_08 TCTCGGTT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN B 2
206 VK7_dead_09 VK7_dead_09 TAAGCGTT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN B 3
207 VK7_dead_10 VK7_dead_10 TCCGTCTT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN B 4
208 VK7_dead_11 VK7_dead_11 TGTACCTT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN B 5
209 VK7_dead_12 VK7_dead_12 TTCTGTGT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN B 6
210 VK7_alive_07 VK7_alive_07 TCTGCTGT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN B 7
211 VK7_alive_08 VK7_alive_08 TTGGAGGT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN B 8
212 VK7_alive_09 VK7_alive_09 TCGAGCGT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN B 9
213 VK7_alive_10 VK7_alive_10 TGATACGT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN B 10
214 VK7_alive_11 VK7_alive_11 TGCATAGT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN B 11
215 VK7_alive_12 VK7_alive_12 TTGACTCT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN B 12
216 VK7_dead_13 VK7_dead_13 TGCGATCT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN C 1
217 VK7_dead_14 VK7_dead_14 TTCCTGCT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN C 2
218 VK7_dead_15 VK7_dead_15 TAGTGACT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN C 3
219 VK7_dead_16 VK7_dead_16 TACAGGAT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN C 4
220 VK7_dead_17 VK7_dead_17 TCCTCAAT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN C 5
221 VK7_dead_04_dil VK7_dead_04_dil TGTGGTTG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN C 6
222 VK7_alive_13 VK7_alive_13 TAGTCTTG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN C 7
223 VK7_alive_14 VK7_alive_14 TTCCATTG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN C 8
224 VK7_alive_15 VK7_alive_15 TCGAAGTG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN C 9
225 VK7_alive_16 VK7_alive_16 TAACGCTG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN C 10
226 VK7_alive_17 VK7_alive_17 TTGGTATG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN C 11
227 VK7_alive_18 VK7_alive_18 TGAACTGG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN C 12
228 VK7_dead_18 VK7_dead_18 TACTTCGG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN D 1
229 VK7_dead_19 VK7_dead_19 TCTCACGG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN D 2
230 VK7_dead_20 VK7_dead_20 TCAGGAGG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN D 3
231 VK7_dead_21 VK7_dead_21 TAAGTTCG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN D 4
232 VK7_dead_22 VK7_dead_22 TCCAGTCG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN D 5
233 VK7_dead_10_dil VK7_dead_10_dil TGTATGCG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN D 6
234 VK7_alive_19 VK7_alive_19 TCATTGAG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN D 7
235 VK7_alive_20 VK7_alive_20 TGGCTCAG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN D 8
236 VK7_alive_21 VK7_alive_21 TATGCCAG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN D 9
237 VK7_alive_22 VK7_alive_22 TCAGATTC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN D 10
238 VK7_alive_23 VK7_alive_23 TACTAGTC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN D 11
239 VK7_alive_24 VK7_alive_24 TTCAGCTC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN D 12
240 VK7_dead_23 VK7_dead_23 TGTCTATC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN E 1
241 VK7_dead_24 VK7_dead_24 TATGTGGC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN E 2
242 VK7_dead_25 VK7_dead_25 TTACTCGC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN E 3
243 VK7_dead_26 VK7_dead_26 TCGTTAGC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN E 4
244 VK7_dead_27 VK7_dead_27 TACCGAGC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN E 5
245 VK7_dead_16_dil VK7_dead_16_dil TGTTCTCC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN E 6
246 VK7_alive_25 VK7_alive_25 TTCGCACC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN E 7
247 VK7_alive_26 VK7_alive_26 TTGCGTAC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN E 8
248 VK7_alive_27 VK7_alive_27 TCTACGAC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN E 9
249 VK7_alive_28 VK7_alive_28 TGACAGAC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN E 10
250 VK7_alive_29 VK7_alive_29 TAGAACAC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN E 11
251 VK7_alive_30 VK7_alive_30 TCATCCTA TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN E 12
252 VK7_dead_28 VK7_dead_28 TGCTGATA TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN F 1
253 VK7_dead_29 VK7_dead_29 TAGACGGA TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN F 2
254 VK7_dead_30 VK7_dead_30 TGTGAAGA TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN F 3
255 VK7_dead_31 VK7_dead_31 TCTCTTCA TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN F 4
256 VK7_dead_32 VK7_dead_32 TTGTTCCA TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN F 5
257 VK7_dead_22_dil VK7_dead_22_dil TGAAGCCA TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN F 6
258 VK7_alive_31 VK7_alive_31 TACCACCA TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN F 7
259 VK7_alive_32 VK7_alive_32 TGCGTGAA TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN F 8
260 VK7_alive_33 VK7_alive_33 GGTGAGTT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN F 9
261 VK7_alive_34 VK7_alive_34 GATCTCTT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN F 10
262 VK7_alive_35 VK7_alive_35 GTGTCCTT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN F 11
263 VK7_alive_36 VK7_alive_36 GACGGATT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN F 12
264 VK7_dead_33 VK7_dead_33 GCAACATT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN G 1
265 VK7_dead_34 VK7_dead_34 GGTCGTGT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN G 2
266 VK7_dead_35 VK7_dead_35 GAATCTGT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN G 3
267 VK7_dead_36 VK7_dead_36 GTACATCT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN G 4
268 VK7_dead_37 VK7_dead_37 GAGGTGCT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN G 5
269 VK7_dead_28_dil VK7_dead_28_dil GCATGGCT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN G 6
270 VK7_alive_37 VK7_alive_37 GTTAGCCT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN G 7
271 VK7_alive_38 VK7_alive_38 GTCGCTAT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN G 8
272 VK7_alive_39 VK7_alive_39 GGAATGAT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN G 9
273 VK7_alive_40 VK7_alive_40 GAGCCAAT TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN G 10
274 VK7_alive_41 VK7_alive_41 GCTCCTTG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN G 11
275 VK7_alive_42 VK7_alive_42 GTAAGGTG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN G 12
276 VK7_dead_38 VK7_dead_38 GAGGATGG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN H 1
277 VK7_dead_39 VK7_dead_39 GTTGTCGG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN H 2
278 VK7_dead_40 VK7_dead_40 GGATTAGG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN H 3
279 VK7_dead_41 VK7_dead_41 GATAGAGG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN H 4
280 VK7_dead_42 VK7_dead_42 GTGTGTCG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN H 5
281 VK7_dead_34_dil VK7_dead_34_dil GCAATCCG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN H 6
282 VK7_alive_43 VK7_alive_43 GACCTTAG TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN H 7
283 VK7_alive_44 VK7_alive_44 GCCTGTTC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN H 8
284 VK7_alive_45 VK7_alive_45 GCACTGTC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN H 9
285 VK7_alive_46 VK7_alive_46 GCTAACTC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN H 10
286 VK7_alive_47 VK7_alive_47 GATTCATC TATCCTCT 10 coluzzii VK7 Burkina Faso NaN NaN H 11
287 VK7_Negative VK7_Negative GTCTTGGC TATCCTCT 10 NaN VK7 Burkina Faso NaN NaN H 12
288 Siaya_Delta_Dead_01 Siaya_Delta_Dead_01 ATCACGTT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 1
289 Siaya_Delta_Dead_02 Siaya_Delta_Dead_02 CGATGTTT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 2
290 Siaya_Delta_Dead_03 Siaya_Delta_Dead_03 TTAGGCAT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 3
291 Siaya_Delta_Dead_04 Siaya_Delta_Dead_04 TGACCACT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 4
292 Siaya_Delta_Dead_05 Siaya_Delta_Dead_05 ACAGTGGT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 5
293 Siaya_Delta_Dead_06 Siaya_Delta_Dead_06 GCCAATGT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 6
294 Siaya_Delta_Dead_07 Siaya_Delta_Dead_07 CAGATCTG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 7
295 Siaya_Delta_Dead_08 Siaya_Delta_Dead_08 ACTTGATG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 8
296 Siaya_Delta_Dead_09 Siaya_Delta_Dead_09 GATCAGCG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 9
297 Siaya_Delta_Dead_10 Siaya_Delta_Dead_10 TAGCTTGT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 10
298 Siaya_Delta_Dead_11 Siaya_Delta_Dead_11 GGCTACAG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 11
299 Siaya_Delta_Dead_12 Siaya_Delta_Dead_12 CTTGTACT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 12
300 Siaya_Delta_Dead_13 Siaya_Delta_Dead_13 TGGTTGTT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 1
301 Siaya_Delta_Dead_14 Siaya_Delta_Dead_14 TCTCGGTT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 2
302 Siaya_Delta_Dead_15 Siaya_Delta_Dead_15 TAAGCGTT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 3
303 Siaya_Delta_Dead_16 Siaya_Delta_Dead_16 TCCGTCTT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 4
304 Siaya_Delta_Dead_17 Siaya_Delta_Dead_17 TGTACCTT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 5
305 Siaya_Delta_Dead_18 Siaya_Delta_Dead_18 TTCTGTGT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 6
306 Siaya_Delta_Dead_19 Siaya_Delta_Dead_19 TCTGCTGT GTAAGGAG 12 uncertain Siaya Kenya NaN NaN B 7
307 Siaya_Delta_Dead_20 Siaya_Delta_Dead_20 TTGGAGGT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 8
308 Siaya_Delta_Dead_21 Siaya_Delta_Dead_21 TCGAGCGT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 9
309 Siaya_Delta_Dead_22 Siaya_Delta_Dead_22 TGATACGT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 10
310 Siaya_Delta_Dead_23 Siaya_Delta_Dead_23 TGCATAGT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 11
311 Siaya_Delta_Dead_24 Siaya_Delta_Dead_24 TTGACTCT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 12
312 Siaya_Delta_Dead_25 Siaya_Delta_Dead_25 TGCGATCT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 1
313 Siaya_Delta_Dead_26 Siaya_Delta_Dead_26 TTCCTGCT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 2
314 Siaya_Delta_Dead_27 Siaya_Delta_Dead_27 TAGTGACT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 3
315 Siaya_Delta_Dead_28 Siaya_Delta_Dead_28 TACAGGAT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 4
316 Siaya_Delta_Dead_29 Siaya_Delta_Dead_29 TCCTCAAT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 5
317 Siaya_Delta_Dead_30 Siaya_Delta_Dead_30 TGTGGTTG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 6
318 Siaya_Delta_Dead_31 Siaya_Delta_Dead_31 TAGTCTTG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 7
319 Siaya_Delta_Dead_32 Siaya_Delta_Dead_32 TTCCATTG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 8
320 Siaya_Delta_Dead_33 Siaya_Delta_Dead_33 TCGAAGTG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 9
321 Siaya_Delta_Dead_34 Siaya_Delta_Dead_34 TAACGCTG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 10
322 Siaya_Delta_Dead_35 Siaya_Delta_Dead_35 TTGGTATG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 11
323 Siaya_Delta_Dead_36 Siaya_Delta_Dead_36 TGAACTGG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 12
324 Siaya_Delta_Dead_37 Siaya_Delta_Dead_37 TACTTCGG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 1
325 Siaya_Delta_Dead_38 Siaya_Delta_Dead_38 TCTCACGG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 2
326 Siaya_Delta_Dead_39 Siaya_Delta_Dead_39 TCAGGAGG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 3
327 Siaya_Delta_Dead_40 Siaya_Delta_Dead_40 TAAGTTCG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 4
328 Siaya_Delta_Dead_41 Siaya_Delta_Dead_41 TCCAGTCG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 5
329 Siaya_Delta_Dead_42 Siaya_Delta_Dead_42 TGTATGCG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 6
330 Siaya_Delta_Dead_43 Siaya_Delta_Dead_43 TCATTGAG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 7
331 Siaya_Delta_Dead_44 Siaya_Delta_Dead_44 TGGCTCAG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 8
332 Siaya_Delta_Dead_45 Siaya_Delta_Dead_45 TATGCCAG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 9
333 Siaya_Delta_Dead_46 Siaya_Delta_Dead_46 TCAGATTC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 10
334 Siaya_Delta_Dead_47 Siaya_Delta_Dead_47 TACTAGTC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 11
335 Siaya_Delta_Dead_48 Siaya_Delta_Dead_48 TTCAGCTC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 12
336 Siaya_Delta_Dead_49 Siaya_Delta_Dead_49 TGTCTATC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 1
337 Siaya_Delta_Dead_50 Siaya_Delta_Dead_50 TATGTGGC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 2
338 Siaya_Delta_Dead_51 Siaya_Delta_Dead_51 TTACTCGC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 3
339 Siaya_Delta_Dead_52 Siaya_Delta_Dead_52 TCGTTAGC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 4
340 Siaya_Delta_Dead_53 Siaya_Delta_Dead_53 TACCGAGC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 5
341 Siaya_Delta_Dead_54 Siaya_Delta_Dead_54 TGTTCTCC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 6
342 Siaya_Delta_Dead_55 Siaya_Delta_Dead_55 TTCGCACC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 7
343 Siaya_Delta_Dead_56 Siaya_Delta_Dead_56 TTGCGTAC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 8
344 Siaya_Delta_Dead_57 Siaya_Delta_Dead_57 TCTACGAC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 9
345 Siaya_Delta_Dead_58 Siaya_Delta_Dead_58 TGACAGAC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 10
346 Siaya_Delta_Dead_59 Siaya_Delta_Dead_59 TAGAACAC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 11
347 Siaya_Delta_Dead_60 Siaya_Delta_Dead_60 TCATCCTA GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 12
348 Siaya_Delta_Dead_61 Siaya_Delta_Dead_61 TGCTGATA GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 1
349 Siaya_Delta_Dead_62 Siaya_Delta_Dead_62 TAGACGGA GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 2
350 Siaya_Delta_Dead_63 Siaya_Delta_Dead_63 TGTGAAGA GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 3
351 Siaya_Delta_Dead_64 Siaya_Delta_Dead_64 TCTCTTCA GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 4
352 Siaya_Delta_Dead_65 Siaya_Delta_Dead_65 TTGTTCCA GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 5
353 Siaya_Delta_Dead_66 Siaya_Delta_Dead_66 TGAAGCCA GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 6
354 Siaya_Delta_Dead_67 Siaya_Delta_Dead_67 TACCACCA GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 7
355 Siaya_Delta_Dead_68 Siaya_Delta_Dead_68 TGCGTGAA GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 8
356 Siaya_Delta_Dead_69 Siaya_Delta_Dead_69 GGTGAGTT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 9
357 Siaya_Delta_Dead_70 Siaya_Delta_Dead_70 GATCTCTT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 10
358 Siaya_Delta_Dead_71 Siaya_Delta_Dead_71 GTGTCCTT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 11
359 Siaya_Delta_Dead_72 Siaya_Delta_Dead_72 GACGGATT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 12
360 Siaya_Delta_Dead_73 Siaya_Delta_Dead_73 GCAACATT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 1
361 Siaya_Delta_Dead_74 Siaya_Delta_Dead_74 GGTCGTGT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 2
362 Siaya_Delta_Dead_75 Siaya_Delta_Dead_75 GAATCTGT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 3
363 Siaya_Delta_Dead_76 Siaya_Delta_Dead_76 GTACATCT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 4
364 Siaya_Delta_Dead_77 Siaya_Delta_Dead_77 GAGGTGCT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 5
365 Siaya_Delta_Dead_78 Siaya_Delta_Dead_78 GCATGGCT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 6
366 Siaya_Delta_Dead_79 Siaya_Delta_Dead_79 GTTAGCCT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 7
367 Siaya_Delta_Dead_80 Siaya_Delta_Dead_80 GTCGCTAT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 8
368 Siaya_Delta_Dead_81 Siaya_Delta_Dead_81 GGAATGAT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 9
369 Siaya_Delta_Dead_82 Siaya_Delta_Dead_82 GAGCCAAT GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 10
370 Siaya_Delta_Dead_83 Siaya_Delta_Dead_83 GCTCCTTG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 11
371 Siaya_Delta_Dead_84 Siaya_Delta_Dead_84 GTAAGGTG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 12
372 Siaya_Delta_Dead_85 Siaya_Delta_Dead_85 GAGGATGG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 1
373 Siaya_Delta_Dead_86 Siaya_Delta_Dead_86 GTTGTCGG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 2
374 Siaya_Delta_Dead_87 Siaya_Delta_Dead_87 GGATTAGG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 3
375 Siaya_Delta_Dead_88 Siaya_Delta_Dead_88 GATAGAGG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 4
376 Siaya_Delta_Dead_89 Siaya_Delta_Dead_89 GTGTGTCG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 5
377 Siaya_Delta_Dead_90 Siaya_Delta_Dead_90 GCAATCCG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 6
378 Siaya_Delta_Dead_91 Siaya_Delta_Dead_91 GACCTTAG GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 7
379 Siaya_Delta_Dead_92 Siaya_Delta_Dead_92 GCCTGTTC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 8
380 Siaya_Delta_Dead_93 Siaya_Delta_Dead_93 GCACTGTC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 9
381 Siaya_Delta_Dead_94 Siaya_Delta_Dead_94 GCTAACTC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 10
382 Siaya_Delta_Dead_95 Siaya_Delta_Dead_95 GATTCATC GTAAGGAG 12 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 11
383 Siaya_Delta_Dead_Negative Siaya_Delta_Dead_Negative GTCTTGGC GTAAGGAG 12 NaN Siaya Kenya NaN NaN H 12
384 Siaya_Delta_Alive_01 Siaya_Delta_Alive_01 ATCACGTT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 1
385 Siaya_Delta_Alive_02 Siaya_Delta_Alive_02 CGATGTTT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 2
386 Siaya_Delta_Alive_03 Siaya_Delta_Alive_03 TTAGGCAT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 3
387 Siaya_Delta_Alive_04 Siaya_Delta_Alive_04 TGACCACT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 4
388 Siaya_Delta_Alive_05 Siaya_Delta_Alive_05 ACAGTGGT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 5
389 Siaya_Delta_Alive_06 Siaya_Delta_Alive_06 GCCAATGT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 6
390 Siaya_Delta_Alive_07 Siaya_Delta_Alive_07 CAGATCTG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 7
391 Siaya_Delta_Alive_08 Siaya_Delta_Alive_08 ACTTGATG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 8
392 Siaya_Delta_Alive_09 Siaya_Delta_Alive_09 GATCAGCG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 9
393 Siaya_Delta_Alive_10 Siaya_Delta_Alive_10 TAGCTTGT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 10
394 Siaya_Delta_Alive_11 Siaya_Delta_Alive_11 GGCTACAG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 11
395 Siaya_Delta_Alive_12 Siaya_Delta_Alive_12 CTTGTACT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 12
396 Siaya_Delta_Alive_13 Siaya_Delta_Alive_13 TGGTTGTT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 1
397 Siaya_Delta_Alive_14 Siaya_Delta_Alive_14 TCTCGGTT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 2
398 Siaya_Delta_Alive_15 Siaya_Delta_Alive_15 TAAGCGTT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 3
399 Siaya_Delta_Alive_16 Siaya_Delta_Alive_16 TCCGTCTT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 4
400 Siaya_Delta_Alive_17 Siaya_Delta_Alive_17 TGTACCTT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 5
401 Siaya_Delta_Alive_18 Siaya_Delta_Alive_18 TTCTGTGT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 6
402 Siaya_Delta_Alive_19 Siaya_Delta_Alive_19 TCTGCTGT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 7
403 Siaya_Delta_Alive_20 Siaya_Delta_Alive_20 TTGGAGGT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 8
404 Siaya_Delta_Alive_21 Siaya_Delta_Alive_21 TCGAGCGT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 9
405 Siaya_Delta_Alive_22 Siaya_Delta_Alive_22 TGATACGT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 10
406 Siaya_Delta_Alive_23 Siaya_Delta_Alive_23 TGCATAGT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 11
407 Siaya_Delta_Alive_24 Siaya_Delta_Alive_24 TTGACTCT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 12
408 Siaya_Delta_Alive_25 Siaya_Delta_Alive_25 TGCGATCT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 1
409 Siaya_Delta_Alive_26 Siaya_Delta_Alive_26 TTCCTGCT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 2
410 Siaya_Delta_Alive_27 Siaya_Delta_Alive_27 TAGTGACT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 3
411 Siaya_Delta_Alive_28 Siaya_Delta_Alive_28 TACAGGAT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 4
412 Siaya_Delta_Alive_29 Siaya_Delta_Alive_29 TCCTCAAT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 5
413 Siaya_Delta_Alive_30 Siaya_Delta_Alive_30 TGTGGTTG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 6
414 Siaya_Delta_Alive_31 Siaya_Delta_Alive_31 TAGTCTTG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 7
415 Siaya_Delta_Alive_32 Siaya_Delta_Alive_32 TTCCATTG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 8
416 Siaya_Delta_Alive_33 Siaya_Delta_Alive_33 TCGAAGTG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 9
417 Siaya_Delta_Alive_34 Siaya_Delta_Alive_34 TAACGCTG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 10
418 Siaya_Delta_Alive_35 Siaya_Delta_Alive_35 TTGGTATG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 11
419 Siaya_Delta_Alive_36 Siaya_Delta_Alive_36 TGAACTGG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 12
420 Siaya_Delta_Alive_37 Siaya_Delta_Alive_37 TACTTCGG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 1
421 Siaya_Delta_Alive_38 Siaya_Delta_Alive_38 TCTCACGG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 2
422 Siaya_Delta_Alive_39 Siaya_Delta_Alive_39 TCAGGAGG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 3
423 Siaya_Delta_Alive_40 Siaya_Delta_Alive_40 TAAGTTCG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 4
424 Siaya_Delta_Alive_41 Siaya_Delta_Alive_41 TCCAGTCG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 5
425 Siaya_Delta_Alive_42 Siaya_Delta_Alive_42 TGTATGCG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 6
426 Siaya_Delta_Alive_43 Siaya_Delta_Alive_43 TCATTGAG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 7
427 Siaya_Delta_Alive_44 Siaya_Delta_Alive_44 TGGCTCAG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 8
428 Siaya_Delta_Alive_45 Siaya_Delta_Alive_45 TATGCCAG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 9
429 Siaya_Delta_Alive_46 Siaya_Delta_Alive_46 TCAGATTC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 10
430 Siaya_Delta_Alive_47 Siaya_Delta_Alive_47 TACTAGTC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 11
431 Siaya_Delta_Alive_48 Siaya_Delta_Alive_48 TTCAGCTC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 12
432 Siaya_Delta_Alive_49 Siaya_Delta_Alive_49 TGTCTATC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 1
433 Siaya_Delta_Alive_50 Siaya_Delta_Alive_50 TATGTGGC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 2
434 Siaya_Delta_Alive_51 Siaya_Delta_Alive_51 TTACTCGC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 3
435 Siaya_Delta_Alive_52 Siaya_Delta_Alive_52 TCGTTAGC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 4
436 Siaya_Delta_Alive_53 Siaya_Delta_Alive_53 TACCGAGC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 5
437 Siaya_Delta_Alive_54 Siaya_Delta_Alive_54 TGTTCTCC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 6
438 Siaya_Delta_Alive_55 Siaya_Delta_Alive_55 TTCGCACC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 7
439 Siaya_Delta_Alive_56 Siaya_Delta_Alive_56 TTGCGTAC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 8
440 Siaya_Delta_Alive_57 Siaya_Delta_Alive_57 TCTACGAC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 9
441 Siaya_Delta_Alive_58 Siaya_Delta_Alive_58 TGACAGAC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 10
442 Siaya_Delta_Alive_59 Siaya_Delta_Alive_59 TAGAACAC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 11
443 Siaya_Delta_Alive_60 Siaya_Delta_Alive_60 TCATCCTA GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 12
444 Siaya_Delta_Alive_61 Siaya_Delta_Alive_61 TGCTGATA GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 1
445 Siaya_Delta_Alive_62 Siaya_Delta_Alive_62 TAGACGGA GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 2
446 Siaya_Delta_Alive_63 Siaya_Delta_Alive_63 TGTGAAGA GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 3
447 Siaya_Delta_Alive_64 Siaya_Delta_Alive_64 TCTCTTCA GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 4
448 Siaya_Delta_Alive_65 Siaya_Delta_Alive_65 TTGTTCCA GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 5
449 Siaya_Delta_Alive_66 Siaya_Delta_Alive_66 TGAAGCCA GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 6
450 Siaya_Delta_Alive_67 Siaya_Delta_Alive_67 TACCACCA GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 7
451 Siaya_Delta_Alive_68 Siaya_Delta_Alive_68 TGCGTGAA GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 8
452 Siaya_Delta_Alive_69 Siaya_Delta_Alive_69 GGTGAGTT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 9
453 Siaya_Delta_Alive_70 Siaya_Delta_Alive_70 GATCTCTT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 10
454 Siaya_Delta_Alive_71 Siaya_Delta_Alive_71 GTGTCCTT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 11
455 Siaya_Delta_Alive_72 Siaya_Delta_Alive_72 GACGGATT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 12
456 Siaya_Delta_Alive_73 Siaya_Delta_Alive_73 GCAACATT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 1
457 Siaya_Delta_Alive_74 Siaya_Delta_Alive_74 GGTCGTGT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 2
458 Siaya_Delta_Alive_75 Siaya_Delta_Alive_75 GAATCTGT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 3
459 Siaya_Delta_Alive_76 Siaya_Delta_Alive_76 GTACATCT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 4
460 Siaya_Delta_Alive_77 Siaya_Delta_Alive_77 GAGGTGCT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 5
461 Siaya_Delta_Alive_78 Siaya_Delta_Alive_78 GCATGGCT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 6
462 Siaya_Delta_Alive_79 Siaya_Delta_Alive_79 GTTAGCCT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 7
463 Siaya_Delta_Alive_80 Siaya_Delta_Alive_80 GTCGCTAT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 8
464 Siaya_Delta_Alive_81 Siaya_Delta_Alive_81 GGAATGAT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 9
465 Siaya_Delta_Alive_82 Siaya_Delta_Alive_82 GAGCCAAT GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 10
466 Siaya_Delta_Alive_83 Siaya_Delta_Alive_83 GCTCCTTG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 11
467 Siaya_Delta_Alive_84 Siaya_Delta_Alive_84 GTAAGGTG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 12
468 Siaya_Delta_Alive_85 Siaya_Delta_Alive_85 GAGGATGG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 1
469 Siaya_Delta_Alive_86 Siaya_Delta_Alive_86 GTTGTCGG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 2
470 Siaya_Delta_Alive_87 Siaya_Delta_Alive_87 GGATTAGG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 3
471 Siaya_Delta_Alive_88 Siaya_Delta_Alive_88 GATAGAGG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 4
472 Siaya_Delta_Alive_89 Siaya_Delta_Alive_89 GTGTGTCG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 5
473 Siaya_Delta_Alive_90 Siaya_Delta_Alive_90 GCAATCCG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 6
474 Siaya_Delta_Alive_91 Siaya_Delta_Alive_91 GACCTTAG GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 7
475 Siaya_Delta_Alive_92 Siaya_Delta_Alive_92 GCCTGTTC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 8
476 Siaya_Delta_Alive_93 Siaya_Delta_Alive_93 GCACTGTC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 9
477 Siaya_Delta_Alive_94 Siaya_Delta_Alive_94 GCTAACTC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 10
478 Siaya_Delta_Alive_95 Siaya_Delta_Alive_95 GATTCATC GAGCCTTA 15 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 11
479 Siaya_Delta_Alive_Negative Siaya_Delta_Alive_Negative GTCTTGGC GAGCCTTA 15 NaN Siaya Kenya NaN NaN H 12
480 Siaya_Delta_Dead_96 Siaya_Delta_Dead_96 ATCACGTT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 1
481 Siaya_Delta_Dead_97 Siaya_Delta_Dead_97 CGATGTTT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 2
482 Siaya_Delta_Dead_98 Siaya_Delta_Dead_98 TTAGGCAT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 3
483 Siaya_Delta_Dead_99 Siaya_Delta_Dead_99 TGACCACT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 4
484 Siaya_Delta_Dead_100 Siaya_Delta_Dead_100 ACAGTGGT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 5
485 Siaya_Delta_Alive_96 Siaya_Delta_Alive_96 GCCAATGT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 6
486 Siaya_Delta_Alive_97 Siaya_Delta_Alive_97 CAGATCTG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 7
487 Siaya_Delta_Alive_98 Siaya_Delta_Alive_98 ACTTGATG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 8
488 Siaya_Delta_Alive_99 Siaya_Delta_Alive_99 GATCAGCG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN A 9
489 Siaya_Delta_Dead_101 Siaya_Delta_Dead_101 TGGTTGTT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 1
490 Siaya_Delta_Dead_102 Siaya_Delta_Dead_102 TCTCGGTT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 2
491 Siaya_Delta_Dead_103 Siaya_Delta_Dead_103 TAAGCGTT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 3
492 Siaya_Delta_Dead_104 Siaya_Delta_Dead_104 TCCGTCTT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 4
493 Siaya_Delta_Dead_105 Siaya_Delta_Dead_105 TGTACCTT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 5
494 Siaya_Delta_Alive_100 Siaya_Delta_Alive_100 TTCTGTGT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 6
495 Siaya_Delta_Alive_101 Siaya_Delta_Alive_101 TCTGCTGT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 7
496 Siaya_Delta_Alive_102 Siaya_Delta_Alive_102 TTGGAGGT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 8
497 Siaya_Delta_Alive_103 Siaya_Delta_Alive_103 TCGAGCGT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN B 9
498 Siaya_Delta_Dead_106 Siaya_Delta_Dead_106 TGCGATCT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 1
499 Siaya_Delta_Dead_107 Siaya_Delta_Dead_107 TTCCTGCT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 2
500 Siaya_Delta_Dead_108 Siaya_Delta_Dead_108 TAGTGACT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 3
501 Siaya_Delta_Dead_109 Siaya_Delta_Dead_109 TACAGGAT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 4
502 Siaya_Delta_Dead_110 Siaya_Delta_Dead_110 TCCTCAAT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 5
503 Siaya_Delta_Alive_104 Siaya_Delta_Alive_104 TGTGGTTG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 6
504 Siaya_Delta_Alive_105 Siaya_Delta_Alive_105 TAGTCTTG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 7
505 Siaya_Delta_Alive_106 Siaya_Delta_Alive_106 TTCCATTG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 8
506 Siaya_Delta_Alive_107 Siaya_Delta_Alive_107 TCGAAGTG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN C 9
507 Siaya_Delta_Dead_111 Siaya_Delta_Dead_111 TACTTCGG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 1
508 Siaya_Delta_Dead_112 Siaya_Delta_Dead_112 TCTCACGG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 2
509 Siaya_Delta_Dead_113 Siaya_Delta_Dead_113 TCAGGAGG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 3
510 Siaya_Delta_Dead_114 Siaya_Delta_Dead_114 TAAGTTCG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 4
511 Siaya_Delta_Dead_115 Siaya_Delta_Dead_115 TCCAGTCG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 5
512 Siaya_Delta_Alive_108 Siaya_Delta_Alive_108 TGTATGCG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 6
513 Siaya_Delta_Alive_109 Siaya_Delta_Alive_109 TCATTGAG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 7
514 Siaya_Delta_Alive_110 Siaya_Delta_Alive_110 TGGCTCAG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 8
515 Siaya_Delta_Alive_111 Siaya_Delta_Alive_111 TATGCCAG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN D 9
516 Siaya_Delta_Dead_116 Siaya_Delta_Dead_116 TGTCTATC CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 1
517 Siaya_Delta_Dead_117 Siaya_Delta_Dead_117 TATGTGGC CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 2
518 Siaya_Delta_Dead_118 Siaya_Delta_Dead_118 TTACTCGC CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 3
519 Siaya_Delta_Dead_119 Siaya_Delta_Dead_119 TCGTTAGC CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 4
520 Siaya_Delta_Alive_112 Siaya_Delta_Alive_112 TACCGAGC CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 5
521 Siaya_Delta_Alive_113 Siaya_Delta_Alive_113 TGTTCTCC CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 6
522 Siaya_Delta_Alive_114 Siaya_Delta_Alive_114 TTCGCACC CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 7
523 Siaya_Delta_Alive_115 Siaya_Delta_Alive_115 TTGCGTAC CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 8
524 Siaya_Delta_Alive_116 Siaya_Delta_Alive_116 TCTACGAC CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN E 9
525 Siaya_Delta_Dead_120 Siaya_Delta_Dead_120 TGCTGATA CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 1
526 Siaya_Delta_Dead_121 Siaya_Delta_Dead_121 TAGACGGA CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 2
527 Siaya_Delta_Dead_122 Siaya_Delta_Dead_122 TGTGAAGA CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 3
528 Siaya_Delta_Dead_123 Siaya_Delta_Dead_123 TCTCTTCA CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 4
529 Siaya_Delta_Alive_117 Siaya_Delta_Alive_117 TTGTTCCA CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 5
530 Siaya_Delta_Alive_118 Siaya_Delta_Alive_118 TGAAGCCA CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 6
531 Siaya_Delta_Alive_119 Siaya_Delta_Alive_119 TACCACCA CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 7
532 Siaya_Delta_Alive_120 Siaya_Delta_Alive_120 TGCGTGAA CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 8
533 Siaya_Delta_Alive_121 Siaya_Delta_Alive_121 GGTGAGTT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN F 9
534 Siaya_Delta_Dead_124 Siaya_Delta_Dead_124 GCAACATT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 1
535 Siaya_Delta_Dead_125 Siaya_Delta_Dead_125 GGTCGTGT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 2
536 Siaya_Delta_Dead_126 Siaya_Delta_Dead_126 GAATCTGT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 3
537 Siaya_Delta_Dead_127 Siaya_Delta_Dead_127 GTACATCT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 4
538 Siaya_Delta_Alive_122 Siaya_Delta_Alive_122 GAGGTGCT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 5
539 Siaya_Delta_Alive_123 Siaya_Delta_Alive_123 GCATGGCT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 6
540 Siaya_Delta_Alive_124 Siaya_Delta_Alive_124 GTTAGCCT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 7
541 Siaya_Delta_Alive_125 Siaya_Delta_Alive_125 GTCGCTAT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 8
542 Siaya_Delta_Alive_126 Siaya_Delta_Alive_126 GGAATGAT CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN G 9
543 Siaya_Delta_Dead_128 Siaya_Delta_Dead_128 GAGGATGG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 1
544 Siaya_Delta_Dead_129 Siaya_Delta_Dead_129 GTTGTCGG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 2
545 Siaya_Delta_Dead_130 Siaya_Delta_Dead_130 GGATTAGG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 3
546 Siaya_Delta_Dead_131 Siaya_Delta_Dead_131 GATAGAGG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 4
547 Siaya_Delta_Alive_127 Siaya_Delta_Alive_127 GTGTGTCG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 5
548 Siaya_Delta_Alive_128 Siaya_Delta_Alive_128 GCAATCCG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 6
549 Siaya_Delta_Alive_129 Siaya_Delta_Alive_129 GACCTTAG CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 7
550 Siaya_Delta_Alive_130 Siaya_Delta_Alive_130 GCCTGTTC CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 8
551 Siaya_Delta_Alive_131 Siaya_Delta_Alive_131 GCACTGTC CAGGACGT 7 gambiae Siaya Kenya NaN NaN H 9
Contents